第1章　药物靶标 1
1.1 药物靶标的选择和确证 1
1.1.1　靶标选择需考虑的因素 1
1.1.2　靶标选择 4
1.1.3　靶标确证 5
1.2 酶 6
1.2.1　竞争性抑制剂 7
1.2.2　变构抑制剂 17
1.2.3　共价不可逆抑制剂 23
1.2.4　过渡态模拟物 31
1.2.5　自杀底物 35
1.2.6　同工酶的选择性抑制剂 37
1.3 受体 43
1.3.1　拮抗剂 43
1.3.2　完全和部分激动剂 45
1.3.3　拮抗剂与激动剂的互变 46
1.3.4　G蛋白偶联受体（GPCRs） 48
1.3.5　核受体 60
1.3.6　生长因子受体 66
1.3.7　离子型和代谢型受体 66
1.4 离子通道 68
1.4.1　钙通道阻滞剂 68
1.4.2　钠通道阻滞剂 69
1.4.3　钾通道阻滞剂 69
1.5 载体蛋白 70
1.6 结构蛋白 71
1.7 核酸 71
1.8 蛋白质-蛋白质相互作用 73
1.9 拓展阅读 74
1.10 参考文献 75

第2章　苗头/先导化合物的发现 81
2.1 非合理药物设计 81
2.2 天然产物 82
2.2.1　来自植物 82
2.2.2　来自动物 84
2.2.3　来自微生物 87
2.2.4　来自天然配体 87
2.2.5　来自对现有药物的改造 89
2.3 高通量筛选 90
2.4 基于片段的先导化合物发现 93
2.5 DNA编码化合物库 97
2.6 蛋白质水解靶向嵌合体 99
2.7 拓展阅读 108
2.8 参考文献 108

第3章　药代动力学 111
3.1 理化性质 111
3.1.1　亲脂性 111
3.1.2　氢键 116
3.1.3　极性表面积 118
3.1.4　可旋转键 118
3.1.5　类药五规则 119
3.1.6　配体效率 120
3.1.7　亲脂配体效率 121
3.2 吸收 122
3.2.1　药代动力学参数的定义 122
3.2.2　改善溶解度 125
3.2.3　扩散吸收 130
3.2.4　主动运输吸收 131
3.2.5　胞饮作用吸收 136
3.3 分布 136
3.3.1　随血液供应至组织和细胞 136
3.3.2　血脑屏障 139
3.3.3　外排转运蛋白 141
3.3.4　血浆蛋白结合 145
3.4 代谢 149
3.4.1　药物代谢概述 149
3.4.2　细胞色素P450酶 152
3.4.3　药物-药物相互作用 152
3.4.4　Ⅰ相代谢 155
3.4.5　Ⅱ相代谢 164
3.5 排泄 171
3.5.1　肾脏排泄 171
3.5.2　非肾脏排泄 172
3.6 前药 173
3.6.1　克服制剂和给药问题 174
3.6.2　克服吸收障碍 175
3.6.3　克服分布问题 177
3.6.4　克服代谢和排泄问题 178
3.6.5　克服毒性问题 178
3.7 拓展阅读 181
3.8 参考文献 181

第4章　生物电子等排体 188
4.1 引言 188
4.1.1　定义 188
4.1.2　生物电子等排体的应用 188
4.2 氢的电子等排体 194
4.2.1　氘 194
4.2.2　氟 196
4.2.3　氯 200
4.2.4　甲基 201
4.3 烷基的电子等排体 203
4.3.1　O作为CH2的电子等排体 203
4.3.2　环丙烷作为烷基的电子等排体 204
4.3.3　硅作为碳的电子等排体 205
4.3.4　叔丁基的电子等排体 206
4.4 醇、苯酚和硫醇电子等排体 208
4.4.1　醇 208
4.4.2　苯酚 211
4.4.3　硫醇 214
4.5 羧酸及其衍生物电子等排体 215
4.5.1　羧酸 215
4.5.2　异羟肟酸 226
4.5.3　酯和酰胺 228
4.5.4　脲类、胍类和脒类 233
4.6 骨架迁越 236
4.6.1　苯基 236
4.6.2　联苯 238
4.6.3　N替代芳香环中的CH 239
4.6.4　杂环间的电子等排原理 242
4.7 肽电子等排体 245
4.7.1　环化 245
4.7.2　分子内氢键 247
4.7.3　N-甲基化 247
4.7.4　屏蔽 248
4.8 拓展阅读 249
4.9 参考文献 249

第5章　毒性警示结构 256
5.1 反应性亲电体 256
5.1.1　烷化剂 257
5.1.2　Michael受体 260
5.1.3　杂芳族卤化物 263
5.1.4　其他反应性亲电体 264
5.2 DNA嵌入剂 265
5.3 致癌物 266
5.4 代谢“问题”分子 268
5.4.1　苯胺类和酰苯胺类 268
5.4.2　“问题”胺类 275
5.4.3　硝基芳香化合物 281
5.4.4　醌和苯酚 284
5.4.5　含硫化合物 288
5.4.6　肼和酰肼 292
5.4.7　亚甲二氧基苯基片段 296
5.4.8　富电子杂芳族化合物 301
5.5 泛筛选干扰化合物 307
5.5.1　不饱和罗丹宁类 307
5.5.2　酚Mannich碱 309
5.5.3　无效代谢灵丹妙药 311
5.5.4　亚烷基巴比妥酸盐等 311
5.6 结论 313
5.7 参考文献 313

索引 319