第一章概论1
第一节化学信息与化学信息学 1
一、化学信息学的产生和发展 1
二、化学信息学的研究领域 3
三、化学信息资源检索的意义与作用 4
四、化学信息学的课程内容 6
第二节电子信息和数据库 7
一、电子信息 7
二、数据库 8
三、在线数据库 12
第三节信息检索的方法和步骤 17
一、信息检索方法 17
二、信息检索效果的评价 18
三、信息检索技术 20
四、信息检索步骤 23
习题 27

第二章印刷类化学文献信息30
第一节图书分类法简介 30
一、图书馆的重要地位和作用 30
二、图书馆图书的分类系统 30
第二节重要工具书、专著和大全 33
一、工具书 33
二、专著和大全 34
第三节重要化学期刊简介 35
一、综合性自然科学期刊 35
二、化学学科综合性期刊 36
三、专业性化学期刊 37
四、综论类期刊 40
第四节化学文摘 41
一、CA类目 42
二、文摘编排顺序和格式 43
三、文摘著录内容和格式 43
四、CA中的索引 46
五、CA检索的注意事项 50
第五节中国学术期刊评价与中国高被引分析报告 51
一、中国学术期刊评价 51
二、中国高被引分析报告 51
习题 52

第三章常用文摘及全文数据库55
第一节Web of Science数据库 55
一、科学引文索引简介 55
二、Web of Science平台 57
三、Web of Science检索 59
四、检索结果及处理 66
五、期刊引文报告和科研评价指标 70
第二节SciFinder Discovery Platform 74
一、化学文摘社 74
二、CA网络版数据库 75
第三节EI Village数据库 94
一、数据库简介 94
二、数据库检索 95
三、检索结果及处理 98
第四节中国知网 101
一、数据库简介 101
二、文献分类目录 101
三、数据库检索 102
四、检索结果及处理 104
习题 106

第四章常用期刊数据库109
第一节Science Direct数据库 109
一、数据库简介 109
二、期刊 书籍浏览 110
三、数据库检索 110
四、检索结果及处理 112
第二节SpringerLink数据库 113
一、数据库概述 113
二、浏览 114
三、检索方法 114
四、检索结果及处理 115
第三节Wiley Online Library数据库 116
一、概述 116
二、浏览 116
三、检索方法 117
四、检索结果及处理 119
第四节ACS数据库 121
一、概述 121
二、浏览 121
三、检索方式 122
四、检索结果及处理 122
第五节RSC数据库 123
一、概述 123
二、浏览 124
三、检索方法 124
四、检索结果及处理 125
第六节AIP数据库 126
一、概述 126
二、浏览 126
三、检索方法 127
四、检索结果及处理 127
习题 128

第五章特种信息资源131
第一节专利数据库 131
一、专利基础 131
二、中国专利数据库 133
三、美国专利数据库 134
四、欧洲专利数据库 139
五、专利搜索引擎——Google Patent（谷歌专利） 141
第二节CiteSpace知识图谱 142
一、科学知识图谱概述 142
二、CiteSpace软件 145
第三节学位论文 148
一、PQDT 148
二、CALIS学位论文数据库 152
三、中国博士、优秀硕士学位论文全文数据库 153
第四节EndNote的使用 153
一、EndNote简介 153
二、EndNote文献库的创建与文献导入 154
三、EndNote文献库的管理 157
四、EndNote的输出样式 159
五、EndNote和Word结合使用 160
习题 162

第六章常用化学事实数据库164
第一节Reaxys数据库 164
一、数据库简介 164
二、访问界面 165
三、数据库检索 165
四、检索结果及处理 167
五、应用实例 168
第二节NIST Chemistry WebBook 171
一、数据库简介 171
二、数据库检索 172
三、检索结果及处理 175
第三节化学结构检索数据库 177
一、概述 177
二、PubChem数据库 177
三、CSD 180
四、蛋白质数据库 182
第四节ChemFinder 186
一、概述 186
二、检索方法 187
三、检索结果 187
习题 188

第七章数据分析方法190
第一节机器学习 190
一、机器学习过程 191
二、无监督学习 191
三、有监督学习 192
第二节化学计量学 193
一、引言 193
二、多元统计分析 193
三、模式识别 196
第三节神经网络 199
一、概述 199
二、Kohonen网络 200
三、对传神经网络 201
四、反向传播神经网络 201
习题 203

第八章化学结构的表示与可视化206
第一节概述 206
一、化学结构的表示 206
二、二维化学结构的表示和可视化 208
三、三维化学结构的表示和可视化 211
四、大分子化学结构的表示和可视化 214
五、分子表面的显示 216
第二节CAS Draw的使用 218
一、简介 218
二、操作界面 219
三、分子结构图的绘制 220
四、化学反应式的绘制 221
五、其他功能 221
第三节ChemDraw的使用 222
一、简介 222
二、操作界面 222
三、二维分子结构的绘制 226
四、其他功能 231第四节RDKit的使用 233
一、简介 233
二、RDKit的安装 234
三、RDKit的基本操作 234
习题 237

第九章三维分子模型设计240
第一节分子力学和分子建模 240
一、分子力学基本原理 240
二、分子力场参数化 244
三、三维分子模型的构建 245
第二节AutoDock的使用 246
一、简介 246
二、操作界面 247
三、对接准备及对接操作 249
四、对接操作结果分析 256
第三节Chem3D的使用 260
一、简介 260
二、操作界面 260
三、分子模型的操作 263
四、分子模型的构建 266
五、分子结构数据的测定 268
六、分子的计算 269
七、分子表面和分子轨道图形的显示 270
第四节HyperChem的使用 271
一、简介 271
二、工具栏的使用 272
三、菜单命令 273
四、使用实例 292
第五节GaussView的使用 295
一、简介 295
二、操作界面 296
三、分子模型的操作 299
四、分子模型的构建 301
五、分子结构数据的测定 303
六、分子的计算 304
七、计算结果的显示 305
习题 307

参考文献310