- 中国林业出版社
- 9787521935776
- 1版
- 2026-02
- 理学
- 生物科学类
- 生物科学
- 本科
内容简介
本教材是一本简明实用
的生物信息学实验指导，共
包括29个实验，涵盖以下核
心内容：Entrez检索系统应
用、GenBank和EMBL数据
格式解析、DNA及蛋白质序
列分析、真核生物基因识别
、蛋白质理化性质与结构预
测、信号肽预测、数据库搜
索、引物设计、基于MEGA
X的进化树构建、密码子偏
好性分析、转录因子结合位
点预测、蛋白质磷酸化位点
预测、R语言与
Bioconductor应用、
Seqlogo图制作、GEO2R分
析、DESeq2差异分析、全
基因组关联分析等。
编者基于教学实践，教
程采用分步骤的方式编写内
容，旨在帮助学生了解并掌
握常用生物信息学资源与工
具的核心使用方法。本教材
适合非生物信息学专业但与
生物学相关专业的学生学习
使用，也可供从事生物学教
学与研究的人员参考。
的生物信息学实验指导，共
包括29个实验，涵盖以下核
心内容：Entrez检索系统应
用、GenBank和EMBL数据
格式解析、DNA及蛋白质序
列分析、真核生物基因识别
、蛋白质理化性质与结构预
测、信号肽预测、数据库搜
索、引物设计、基于MEGA
X的进化树构建、密码子偏
好性分析、转录因子结合位
点预测、蛋白质磷酸化位点
预测、R语言与
Bioconductor应用、
Seqlogo图制作、GEO2R分
析、DESeq2差异分析、全
基因组关联分析等。
编者基于教学实践，教
程采用分步骤的方式编写内
容，旨在帮助学生了解并掌
握常用生物信息学资源与工
具的核心使用方法。本教材
适合非生物信息学专业但与
生物学相关专业的学生学习
使用，也可供从事生物学教
学与研究的人员参考。
目录
前言
实验1 Entrez检索系统的使用
实验2 GenBank和EMBL数据记录格式
实验3 重复序列分析
实验4 开放阅读框分析
实验5 真核生物基因识别
实验6 蛋白质理化性质预测分析
实验7 蛋白质二级结构预测
实验8 蛋白质三级结构预测
实验9 蛋白质跨膜结构域预测
实验10 信号肽预测
实验11 核苷酸和蛋白质序列为基础的数据库搜索
实验12 引物设计
实验13 利用MEGA X进行进化树分析
实验14 使用codonW进行密码子偏好性分析
实验15 利用JASPAR分析转录因子结合位点
实验16 NetPhos 3.1 Server进行蛋白质磷酸化位点预测
实验17 Windows下R与RStudio的安装
实验18 Bioconductor包的安装与使用
实验19 向量的创建和操作
实验20 数据框的创建与操作
实验21 列表的创建与操作
实验22 R数据的导入与导出
实验23 数据的操控
实验24 R语言绘图
实验25 Seqlogo图制作
实验26 GEO2R分析基因的差异表达
实验27 DESeq2差异分析
实验28 DAVID富集分析
实验29 全基因组关联分析
参考文献
实验1 Entrez检索系统的使用
实验2 GenBank和EMBL数据记录格式
实验3 重复序列分析
实验4 开放阅读框分析
实验5 真核生物基因识别
实验6 蛋白质理化性质预测分析
实验7 蛋白质二级结构预测
实验8 蛋白质三级结构预测
实验9 蛋白质跨膜结构域预测
实验10 信号肽预测
实验11 核苷酸和蛋白质序列为基础的数据库搜索
实验12 引物设计
实验13 利用MEGA X进行进化树分析
实验14 使用codonW进行密码子偏好性分析
实验15 利用JASPAR分析转录因子结合位点
实验16 NetPhos 3.1 Server进行蛋白质磷酸化位点预测
实验17 Windows下R与RStudio的安装
实验18 Bioconductor包的安装与使用
实验19 向量的创建和操作
实验20 数据框的创建与操作
实验21 列表的创建与操作
实验22 R数据的导入与导出
实验23 数据的操控
实验24 R语言绘图
实验25 Seqlogo图制作
实验26 GEO2R分析基因的差异表达
实验27 DESeq2差异分析
实验28 DAVID富集分析
实验29 全基因组关联分析
参考文献
